Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS3Q969F9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms