Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4BQ92750 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms