Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms