Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN4Q92575 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN4Q92575 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms