Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSC1Q92574 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC1Q92574 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms