Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF31Q8WWY3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.1 ms