Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3TC2Q8TF17 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3TC2Q8TF17 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms