Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC148Q8NFR7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC148Q8NFR7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms