Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP35Q8NFH5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms