Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSNK2A3Q8NEV1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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