Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC191Q8NCU4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC191Q8NCU4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms