Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF38AQ8NAV1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms