Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAN2

MIGA1, Mitoguardin 1, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIGA1Q8NAN2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MIGA1Q8NAN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MIGA1Q8NAN2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MIGA1Q8NAN2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIGA1Q8NAN2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIGA1Q8NAN2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIGA1Q8NAN2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MIGA1Q8NAN2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms