Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNBD1Q8NA66 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNBD1Q8NA66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms