Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNLDC1Q8NA58 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms