Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROM2Q8N271 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PROM2Q8N271 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms