Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF28Q8N1W1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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