Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSIG10Q8N0Z9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSIG10Q8N0Z9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms