Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms