Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASSF3Q86WH2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms