Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX7Q7RTT5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms