Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SV2AQ7L0J3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms