Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZRN4Q6ZMN7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN4Q6ZMN7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms