Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL17Q6UXB2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL17Q6UXB2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms