Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUSD1Q6UWL2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms