Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMBQ6PCB8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms