Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCSAPQ6IQ19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSAPQ6IQ19 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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