Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC8Q6A555 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms