Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUPD1Q68J44 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms