Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3L3Q68CJ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms