Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARP1BQ659C4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms