Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1DP3Q658K8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1DP3Q658K8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms