Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CLQ60I27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CLQ60I27 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms