Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms