Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms