Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms