Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH8Q5T0T0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms