Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHYHD1Q5SRE7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms