Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP188Q5SRE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms