Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms