Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMPD3Q5JV73 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms