Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf116Q5BN46 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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