Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms