Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACSM3Q53FZ2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACSM3Q53FZ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms