Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms