Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC1Q4ZHG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms