Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO43Q4G163 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO43Q4G163 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms