Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms