Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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KRTAP13-3Q3SY46 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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KRTAP13-3Q3SY46 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP13-3Q3SY46 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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