Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCGF3Q3KNV8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms